176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene COXBURSA331_A1788 on replicon NC_010117
Organism: Coxiella burnetii RSA 331



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010117  COXBURSA331_A1788  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0390  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0023  tRNA-Met  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00191996  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0040  tRNA-Met  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.138957  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Met-3  tRNA-Met  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.617808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0011  tRNA-Met  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0167662 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0011  tRNA-Met  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.259096  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0051  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.430637  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Met-3  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0002  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00524383  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0054  tRNA-Met  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0668  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00123939  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1863  tRNA-Met  91.07 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000158589  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  89.06 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  86.84 
 
 
77 bp  71.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0007  tRNA-Met  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt37  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt37  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0051  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00732505  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0076  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.285949  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0046  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.216228  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0041  tRNA-Met  89.29 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00042704  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  89.09 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Met-3  tRNA-Met  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.121443  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0033  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000189228  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0032  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136069  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0008  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t023  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  85.94 
 
 
74 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  85.94 
 
 
77 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0104  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.013625  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0044  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0022  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0120  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0737074  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0120  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000419542  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0114  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00121971  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0117  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000129359  hitchhiker  0.0041219 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1228  tRNA-Met  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  85.94 
 
 
74 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0032  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0772174  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0019  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.682883  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0025  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000863723  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0024  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00918004  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  85.94 
 
 
74 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14007  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0236309 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0036  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0559117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2151  tRNA-Met  84.72 
 
 
77 bp  56  0.000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0974821  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  85.94 
 
 
77 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2266  tRNA-Met  84.72 
 
 
79 bp  56  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.507582  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0028  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0043  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.165772  normal  0.314708 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t099  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0187022  normal  0.469652 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0018  tRNA-Met  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0278993  normal  0.0571882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0055  tRNA-Met  94.29 
 
 
74 bp  54  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0104012 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0016  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00324355  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0057  tRNA-Met  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0200182  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0004  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.425707  normal  0.204781 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0021  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.152482 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t02  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA75  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0005  tRNA-Met  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R95  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0044  tRNA-Met  88.89 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.477154  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0001  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.764109  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0009  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.349151  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0065  tRNA-Met  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0074  tRNA-Met  88.89 
 
 
75 bp  50.1  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00224698  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0001  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0025  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00131136  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0031  tRNA-Lys  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.282035  normal  0.10093 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1165  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.391901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0067  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.021091  normal  0.280221 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0005  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.108014  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0565  tRNA-Met  93.75 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3536  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00370417  hitchhiker  0.000000304392 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0008  tRNA-Met  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.745239  normal  0.522263 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2193  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000427584  hitchhiker  0.000000134605 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1601  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5028  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.523947  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1265  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00276472  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  85.71 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1177  tRNA-Met  88.46 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000000105973  hitchhiker  0.000000000000145149 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>