More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_R0012 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  100 
 
 
76 bp  151  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  98.28 
 
 
76 bp  107  4e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  93.33 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  89.47 
 
 
76 bp  87.7  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  86.84 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  91.07 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.32 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  87.84 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  92 
 
 
73 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  87.14 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  92 
 
 
76 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  87.84 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  87.84 
 
 
79 bp  67.9  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  89.47 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03605  tRNA-Asn  87.5 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t30  tRNA-Met  86.84 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00107522  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0073  tRNA-Lys  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0004  tRNA-Lys  85.53 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0022  tRNA-Lys  95 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03607  tRNA-Asn  87.5 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03597  tRNA-Asn  87.5 
 
 
73 bp  63.9  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0022  tRNA-Met  86.84 
 
 
77 bp  63.9  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0046  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00480541  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0042  tRNA-Asn  89.09 
 
 
76 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.767565  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0024  tRNA-Met  86.67 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000000000329716  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R11  tRNA-Thr  87.93 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0011  tRNA-Met  87.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0039  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000000067349  normal  0.10104 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  87.14 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0016  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00509711  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0028  tRNA-Met  86.49 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152188  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  60  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0011  tRNA-Thr  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000845493  normal  0.021037 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0044  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  86.15 
 
 
73 bp  58  0.0000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  85.51 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0040  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1934  tRNA-Lys  86.15 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.810073  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  91.11 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0055  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0042  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155325  normal  0.0810865 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0061  tRNA-Arg  86.96 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.204064  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1282  tRNA-Arg  86.96 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000513688  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  96.97 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4261  tRNA-Arg  86.96 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000175716  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  87.72 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0052  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000683016  hitchhiker  0.000091513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0048  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  87.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00236112  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0002  tRNA-Lys  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0703  tRNA-Asn  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0021  tRNA-Lys  94.44 
 
 
76 bp  56  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.674818  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  86.67 
 
 
76 bp  56  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  87.5 
 
 
80 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0005  tRNA-Lys  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0035  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0379309  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0036  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0360191  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0037  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00809358  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0038  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0168892  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0039  tRNA-Lys  84.21 
 
 
76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0153762  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0051  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000190999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0053  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000619589  hitchhiker  0.0000900565 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0043  tRNA-Lys  89.58 
 
 
76 bp  56  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0523959 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0004  tRNA-Asn  88.46 
 
 
73 bp  56  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.392598  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna095  tRNA-Asn  85.94 
 
 
76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0004  tRNA-Lys  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna101  tRNA-Asn  85.94 
 
 
76 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000041783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>