More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_R0013 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_R0013  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  151  3e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0012  tRNA-Lys  98.28 
 
 		 76 bp  107  4e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0009  tRNA-Lys  93.1 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.538917  normal  0.55147 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0037  tRNA-Lys  89.39 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0220661  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt02  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.00232285  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0076  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0078  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.184642 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0073  tRNA-Asn  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0062  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0035  tRNA-Lys  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198298 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0006  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.711036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0021  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.13563  hitchhiker  0.00625278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0031  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 73 bp  69.9  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.25441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0028  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.196186  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0036  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0010  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0043  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.465009  normal  0.488782 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0023  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0320395 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 73 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14010  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.5197900000000005e-29  hitchhiker  0.00000218177 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0002  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.409498 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0052  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.292372  normal  0.128808 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0045  tRNA-Met  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000299678  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0003  tRNA-Lys  88.33 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.8235300000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0008  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.054171  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0060  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.268431  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0058  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.314069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14020  tRNA-Asn  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569019  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3206  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3259  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0001  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.46268e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2658  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0806589  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0064  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0550345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1370  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.598749  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3244  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1952  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0056  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0015  tRNA-Lys  89.09 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.424743  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0824  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  89.66 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0703  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0025  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  60  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.445908  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  89.66 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00017  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000192994  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00019  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000148305  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00021  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000923528  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00044  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000150882  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0054  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000153086  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0055  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000177997  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0058  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188503  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0060  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.42893e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0766  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000107183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4660  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.11514e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5023  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000198459  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5020  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000079938  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0771  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000162037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0073  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000623521  normal  0.270802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t61  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.453537  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0666  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000300232  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0031  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0885898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0770  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00251  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1660  tRNA-Lys  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06830  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4659  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  8.951839999999999e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0521  tRNA-Lys  89.8 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4684  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  2.3682299999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5022  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000229653  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00467  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt03  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt03  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA77  tRNA-Thr  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0060  tRNA-Met  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0772  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000175235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0035  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2557  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000373976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0667  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000201635  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0583  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  2.0474e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0038  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000184687  normal  0.110517 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0036  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000225732  normal  0.109866 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0051  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.138562  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4661  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000171362  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5052  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.0000000000000715976  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0039  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000375421  normal  0.109121 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0040  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000000351036  normal  0.107458 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5024  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000192703  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0067  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000904848  normal  0.171031 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0043  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00102089  hitchhiker  0.00032415 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0048  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.636715 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0068  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000208772  normal  0.273161 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0768  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000959618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0071  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000577417  normal  0.268649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>