298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_R0021 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_R0021  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00425805  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07711  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt20  tRNA-Met  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0015  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000155913  normal  0.449065 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0019  tRNA-Met  89.71 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.854123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0009  tRNA-Met  88.06 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000249848  normal  0.901496 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsn01  tRNA-Asn  89.47 
 
 		 80 bp  65.9  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468936 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  87.5 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0056  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  86.57 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0014  tRNA-Asn  88.14 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.032449  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet01  tRNA-Met  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.372552  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0024  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0025  tRNA-Asn  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0217  tRNA-Met  85.94 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00000283281  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0060  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.203868  normal  0.918224 
 
 
-
 
NC_002950  PGt47  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0021  tRNA-Met  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.715825 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0032  tRNA-Asn  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25038  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0006  tRNA-Met  88.24 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111825  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0022  tRNA-Met  94.29 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.164411  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0002  tRNA-Met  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.452925 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0022  tRNA-Met  85.07 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00591364 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0037  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.45674  normal  0.44338 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3562  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3567  tRNA-Met  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0011  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0046  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00275873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0044  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.300921 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0030  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00181999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0031  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000893845  normal  0.390946 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0069  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0074  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135637  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0071  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0043  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0040  tRNA-Met  100 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000293258  hitchhiker  0.00175254 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna33  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0043  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0038  tRNA-Asn  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0020  tRNA-Lys  87.1 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0062  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24920  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.952959 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0026  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000286775 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3154t  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000967763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna132  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0063  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.538601  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0041  tRNA-Met  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.241337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0097  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0061  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna135  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0052  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.058148 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0028  tRNA-Met  91.89 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.822352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0048  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000017739  normal  0.0157813 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0044  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000282394  normal  0.033686 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  93.94 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna143  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000903927  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24910  tRNA-Lys  86.79 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna147  tRNA-Met  93.94 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Val-3  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00184226  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0004  tRNA-Met  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0465145  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19940  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.53121  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0012  tRNA-Lys  92.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000017213  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  87.5 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1248  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.134542  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1372  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000123284 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0046  tRNA-Val  100 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.461452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0032  tRNA-Lys  91.67 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14024  tRNA-Met  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt016  tRNA-Ile  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  100 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0026  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000000000983992  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tVal01  tRNA-Val  86.44 
 
 		 81 bp  46.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.231904  normal  0.628895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>