More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_t0407 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008531  LEUM_t0408  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000000233964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0407  tRNA-Asn  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.000764097  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0193  tRNA-Asn  95.89 
 
 		 73 bp  121  1.9999999999999998e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0452  tRNA-Asn  94.92 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.133298 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1563  tRNA-Asn  94.92 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1796  tRNA-Asn  94.92 
 
 		 73 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  6.3013000000000006e-24 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1802  tRNA-Asn  94.92 
 
 		 76 bp  93.7  5e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000154266 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0014  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000102189  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0012  tRNA-Asn  96.15 
 
 		 73 bp  87.7  3e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0036  tRNA-Lys  94.34 
 
 		 76 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000293435  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0044  tRNA-Lys  94.23 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00224472  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0012  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000406806  normal  0.414735 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0013  tRNA-Thr  88.57 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.476807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0011  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0012  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0016  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0352775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0107  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000354885  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0047  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000112802  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0026  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000388812  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0108  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000399155  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0048  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000002395  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0023  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00169137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0005  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000194874  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0024  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0077208  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0014  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000321021  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0016  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.27479e-28 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0016  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000000000347926  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0014  tRNA-Lys  92.16 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.4767600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0025  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4151  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.565082  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4784  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.00018344  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0040  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0012  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0022  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0098  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000573413  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0080  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000242401  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0100  tRNA-Lys  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000556304  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0052  tRNA-Thr  87.14 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000260506  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  86.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0007  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.00000068563  normal  0.189185 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2619  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0471247  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2626  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2305  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2312  tRNA-Lys  97.3 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0023  tRNA-His  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000017569  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0023  tRNA-His  90.38 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000859824  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0453  tRNA-Lys  90.38 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000219585  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0020  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.768536  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0196539  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0065  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000408633  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0053  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.404904  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0008  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.25278  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0013  tRNA-Lys  90.2 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0036  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000127196  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0093  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.8722200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0051  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111029  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1858  tRNA-Thr  85.71 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0001  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  60  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000658326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0028  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0033  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.146569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0004  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0010  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0021  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.669964  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0078  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857457  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0084  tRNA-Thr  92.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0049  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000660852  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0073  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 79 bp  56  0.000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0073  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0038  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.162193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0009  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000161944  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0060  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.398642  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0084  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00872406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0031  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0034  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.603769 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0050  tRNA-Asn  90.91 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.991113  normal  0.655045 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1581  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1616  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.620085 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14030  tRNA-Lys  94.44 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.36075e-34  hitchhiker  0.0017768 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>