260 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Coch_R0019 on replicon NC_013162
Organism: Capnocytophaga ochracea DSM 7271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013162  Coch_R0019  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.854123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07711  tRNA-Met  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet01  tRNA-Met  91.18 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.372552  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0014  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.032449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0056  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0025  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0024  tRNA-Asn  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt20  tRNA-Met  89.86 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0021  tRNA-Met  89.71 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00425805  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0032  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25038  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt01  tRNA-Asn  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0027  tRNA-Asn  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0014  tRNA-Asn  92 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0043  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0038  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna33  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0043  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0071  tRNA-Asn  88.52 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0025  tRNA-Lys  92.31 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0026  tRNA-Met  97.22 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0211929  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0054  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0048  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0014  tRNA-Asn  93.02 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0015  tRNA-Met  93.02 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000155913  normal  0.449065 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tAsn01  tRNA-Asn  87.93 
 
 		 80 bp  60  0.00000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000468936 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  92.86 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0053  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0006  tRNA-Asn  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.242548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0004  tRNA-Thr  87.69 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00188596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0056  tRNA-Met  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.864924 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0018  tRNA-Met  94.59 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0041  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0044    89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0031  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.199067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0038  tRNA-Lys  88.46 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0051  tRNA-Met  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.430637  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0043  tRNA-Met  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.259921  normal  0.901297 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0046  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0033  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.972639 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  88.14 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0014  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0011  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000213973  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0061  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4332  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0062  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19940  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.53121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0011  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.983753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA35  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.056149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24910  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.948003 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0039  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0040  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0005  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00829837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0011  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000344573  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0009  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.420581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0063  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.538601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24920  tRNA-Lys  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.952959 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0027  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00574952  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0012  tRNA-Lys  87.93 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0003  tRNA-Met  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.879602  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0023  tRNA-Met  88 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.013256 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 79 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0028  tRNA-Arg  86.79 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00528012  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0022  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.134574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t13662  tRNA-Ile  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.148645  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0653  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2173  tRNA-Lys  87.72 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.206805  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  88.68 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>