233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_tAsn01 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008255  CHU_tAsn01  tRNA-Asn  100 
 
 
80 bp  159  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000468936 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0025  tRNA-Asn  93.33 
 
 
77 bp  109  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0024  tRNA-Asn  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07709  tRNA-Asn  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0523717  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt02  tRNA-Asn  90.48 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_002950  PGt01  tRNA-Asn  89.39 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0167081 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0043  tRNA-Asn  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.154925  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0071  tRNA-Asn  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0038  tRNA-Asn  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0746306  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0043  tRNA-Asn  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna33  tRNA-Asn  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.166736  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07711  tRNA-Met  89.83 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.365752  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0021  tRNA-Met  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00425805  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0024  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000360074  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0024  tRNA-Asn  85.33 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt20  tRNA-Met  88.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.771657 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_R0019  tRNA-Met  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.854123  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0014  tRNA-Asn  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0027  tRNA-Asn  92.86 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.582346 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0056  tRNA-Asn  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0014  tRNA-Asn  87.72 
 
 
74 bp  58  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.032449  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3154t  tRNA-Met  90.91 
 
 
74 bp  56  0.000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000967763  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5180  tRNA-Asn  92.5 
 
 
78 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.851962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t11  tRNA-Asn  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000006616  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t36  tRNA-Asn  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.036377  hitchhiker  0.00260797 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1988  tRNA-Asn  92.5 
 
 
78 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.977755  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0026  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.248666  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0075  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.173249  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23490  tRNA-Asn  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00227157  hitchhiker  0.00614087 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60180  tRNA-Asn  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000682049  hitchhiker  0.0000000115444 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0028  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.505293 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0046  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0076  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0515739  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0021  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.503528  normal  0.129544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0004  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0027  tRNA-Asn  92.5 
 
 
76 bp  56  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224743  normal  0.75485 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60060  tRNA-Asn  92.5 
 
 
73 bp  56  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.678993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA22  tRNA-Lys  89.29 
 
 
76 bp  56  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140945  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0053  tRNA-Asn  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.32132  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0006  tRNA-Asn  94.29 
 
 
77 bp  54  0.000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.242548  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0006  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0111825  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0052  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.058148 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0069  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.439816  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0074  tRNA-Met  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.135637  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0006  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.873088  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0007  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.651045  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_R0009  tRNA-Lys  90.7 
 
 
76 bp  54  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01243  tRNA-Met  90.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_4303  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0048  tRNA-Lys  87.93 
 
 
76 bp  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00154367  hitchhiker  0.0000000000357409 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna147  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000833162  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0048  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000017739  normal  0.0157813 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01240  tRNA-Met  90.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tMet01  tRNA-Met  84.85 
 
 
77 bp  52  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.372552  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna132  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna143  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000903927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna135  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01238  tRNA-Met  90.48 
 
 
74 bp  52  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_R0047  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.501158  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0044  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000282394  normal  0.033686 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_R23  tRNA-Ile  94.12 
 
 
77 bp  52  0.00002  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0061  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.714727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3562  tRNA-Met  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.820141  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3567  tRNA-Met  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0010  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.448229  hitchhiker  0.009241 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0090  tRNA-Asn  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613104  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0032  tRNA-Asn  85.96 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25038  normal  0.151728 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0014  tRNA-Asn  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000105704  normal  0.0608768 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3083  tRNA-Ile  86.79 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0086  tRNA-Asn  88.68 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000469656  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0022  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808191  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0033  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0776982  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0053  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00143998  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0063  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0802008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0051  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.094292  normal  0.53316 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0385  tRNA-Ile  86.79 
 
 
79 bp  50.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.900506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0016  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0679005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0047  tRNA-Ile  86.79 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.930435  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R85  tRNA-Asn  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000392711  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0045  tRNA-Lys  87.5 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0394104  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3149t  tRNA-Met  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0028  tRNA-Lys  90 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0097  tRNA-Lys  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt47  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5708  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.115547  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0844  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.639074  normal  0.0213952 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0046  tRNA-Met  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00275873  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0052  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000386072  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0012  tRNA-Met  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.0594499 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4296  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000610451 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0015  tRNA-Met  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000000155913  normal  0.449065 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5791  tRNA-Met  100 
 
 
79 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.815457  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>