186 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0049 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0049  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.488702  normal  0.899504 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1429  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0028  tRNA-Met  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t27  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0964  tRNA-Met  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0491752  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0035  tRNA-Met  98.7 
 
 
76 bp  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.481386  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0037  tRNA-Met  98.7 
 
 
76 bp  137  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0565757  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0035  tRNA-Met  98.7 
 
 
76 bp  137  4e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170326  normal  0.471041 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0033  tRNA-Met  98.7 
 
 
76 bp  137  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.404585  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4572  tRNA-Met  94.81 
 
 
76 bp  113  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0012    93.51 
 
 
76 bp  105  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.735583  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0055  tRNA-Met  93.51 
 
 
76 bp  105  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0053  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.157606  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0045  tRNA-Met  90.91 
 
 
76 bp  89.7  9e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.602401 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4315  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0014  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0047  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.173614 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0015  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.741818  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0045  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.868146  normal  0.416735 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0052  tRNA-Met  89.61 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.35698  normal  0.434285 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0041  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000154494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0049  tRNA-Met  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.175239  decreased coverage  0.00156348 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0047  tRNA-Met  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.236827  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0059  tRNA-Met  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA27  tRNA-Met  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.841539  normal  0.0659835 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0010  tRNA-Met  88.31 
 
 
76 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.132718 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0033  tRNA-Met  90 
 
 
76 bp  71.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0042  tRNA-Met  87.69 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.447058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0053  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.568663 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0017  tRNA-Met  87.69 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000161525  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0016  tRNA-Met  87.69 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000174645  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0019  tRNA-Met  87.69 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000000626399  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0029  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00945673 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0065  tRNA-Met  87.01 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46604  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0059  tRNA-Met  87.01 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.122769  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0064  tRNA-Met  87.01 
 
 
76 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.304655  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0015  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.325787  normal  0.15681 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0063  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0065  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.224549 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_R0081  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0018  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.69443  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0039  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.495047  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6037  tRNA-Met  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.018397  normal  0.113551 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_R0080  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0006  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0343832 
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_R0082  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0066  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0008  tRNA-Met  85.71 
 
 
76 bp  58  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mflt025  tRNA-Arg  96.88 
 
 
77 bp  56  0.000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000274648  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0740  tRNA-Arg  96.88 
 
 
77 bp  56  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1220  tRNA-Met  87.5 
 
 
74 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.400945  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0012  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000647679  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_R0043  tRNA-Met  89.36 
 
 
77 bp  54  0.000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.22018 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0004  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000109106  hitchhiker  0.000000979615 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0008  tRNA-Met  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0008  tRNA-Met  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0077  tRNA-Met  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0006  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  52  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0483173  normal  0.730879 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0033  tRNA-Met  87.04 
 
 
74 bp  52  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.311584 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0018  tRNA-Met  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555384  normal  0.496663 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0062  tRNA-Met  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0374221  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0042  tRNA-Met  85.96 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0020  tRNA-Met  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.929177  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tMet02  tRNA-Met  90.24 
 
 
80 bp  50.1  0.00008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0193377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0056  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000119061  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14170  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.688335  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0041  tRNA-Met  90.24 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  83.12 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0001  tRNA-Met  84.42 
 
 
76 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.220439  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Met-2  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.593397  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0064  tRNA-Arg  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00190165  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0607  tRNA-Met  85.71 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0027  tRNA-Val  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.20425  decreased coverage  0.00178196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0004  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0046  tRNA-Val  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.56925  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0004  tRNA-Arg  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000356411  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02200  tRNA-Arg  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0070  tRNA-Met  87.5 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0320721  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0060  tRNA-Arg  100 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000322774  normal  0.330331 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1749  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0035  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0023  tRNA-Asn  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.909867  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_R0025  tRNA-Asn  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00179903  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0443  tRNA-Met  85.71 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0001  tRNA-Asn  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.432405  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_R0002  tRNA-Asn  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.823848  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0003  tRNA-Arg  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0004  tRNA-Arg  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Met-2  tRNA-Met  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0000219086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0061  tRNA-Arg  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0034  tRNA-Trp  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0532216  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0695  tRNA-Thr  100 
 
 
73 bp  46.1  0.001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0024  tRNA-Trp  96.3 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0015  tRNA-Met  96.3 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000125426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0013  tRNA-Trp  100 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000123102  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0037  tRNA-Met  83.1 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0119  tRNA-Met  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>