55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aazo_R0054 on replicon NC_014248
Organism: 'Nostoc azollae' 0708



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014248  Aazo_R0054  tRNA-Met  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000046509  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0020  tRNA-Met  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0126987  normal  0.390721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0018  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000793329  hitchhiker  0.000000622773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0019  tRNA-Met  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0024  tRNA-Met  86.49 
 
 
73 bp  60  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288853 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2945  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.393325  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0032  tRNA-Met  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.094935  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0003  tRNA-Met  92.86 
 
 
73 bp  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2631  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.830892  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2628  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2625  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2948  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.282487  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2942  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  52  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.265359  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0037  tRNA-Met  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0019  tRNA-Met  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0047  tRNA-Met  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2335  tRNA-Met  93.94 
 
 
77 bp  50.1  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.360729  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0042  tRNA-Met  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.309663  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0304  tRNA-Met  93.75 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.150543  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0084  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.438711  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0033  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0263488  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0092  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0039  tRNA-Met  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0029  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4209  tRNA-Met  93.75 
 
 
79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00407294  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0049  tRNA-Arg  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000329911  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0052  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.526652  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0005  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.203955  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0022  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00591364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0034  tRNA-Met  88.64 
 
 
74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.62589  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0035  tRNA-Met  93.75 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0017  tRNA-Met  88.64 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0012  tRNA-Met  86.27 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.178155  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0035  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0020  tRNA-Met  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.235412  normal  0.107763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t22  tRNA-Met  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna123  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.193593  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0021  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0582206  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02186  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0059  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0059  tRNA-His  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6034  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.93695  normal  0.213156 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6033  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.908357  normal  0.208238 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02187  tRNA-Val  100 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0026  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.522695  normal  0.33035 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0035  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.177187 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0034  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.182102 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0018  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0016  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.816839  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0015  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0014  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.791335  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0088  tRNA-Val  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.109488  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0025  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.103227  normal  0.238575 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0024  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.16238  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4317  tRNA-Asp  100 
 
 
77 bp  44.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.771522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>