16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_R0049 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0029  tRNA-Thr  95.45 
 
 
74 bp  107  4e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.951156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0028  tRNA-Thr  93.75 
 
 
74 bp  95.6  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.490827 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0014  tRNA-Thr  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0027  tRNA-OTHER  89.55 
 
 
73 bp  69.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 
72 bp  60  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_R0029  tRNA-Thr  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  85.71 
 
 
73 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  93.33 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0035  tRNA-Met  100 
 
 
72 bp  44.1  0.004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000027338  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  83.78 
 
 
73 bp  44.1  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  88.1 
 
 
74 bp  44.1  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>