13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_AR0029 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_AR0029  tRNA-Thr  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.951156 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0028  tRNA-Thr  95.71 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.490827 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0049  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000152851  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0027  tRNA-OTHER  91.89 
 
 		 73 bp  91.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_R0014  tRNA-Thr  96.23 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_R0029  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.00440397  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_R0028  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_R0045  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_R0032  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_R0017  tRNA-Thr  90.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.545272  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt05  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 76 bp  48.1  0.0003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000163107  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_R0029  tRNA-Thr  91.67 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553385  normal  0.425342 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_R0028  tRNA-Thr  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>