18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_R0047 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_R0047  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  95.45 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_AR0004  tRNA-Thr  92.31 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.359644  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0051  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0034  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000000469918  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6003  tRNA-Thr  92.11 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.126047  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0006  tRNA-Thr  91.89 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000228394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_R0031  tRNA-Thr  88.64 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0124047 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2233  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000102912  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2191  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000534865  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1673  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000000301806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna6  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.349793  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0017  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000000115919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0014  tRNA-Thr  86.27 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000293663  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07727  tRNA-Thr  87.23 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0088  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000142546  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0025  tRNA-Thr  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000257059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0046  tRNA-Ala  89.47 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>