87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0032 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0580782  normal  0.580774 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  91.03 
 
 		 78 bp  99.6  9e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  89.74 
 
 		 78 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  88.46 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  87.18 
 
 		 78 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0021  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4331  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521695  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0028  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 78 bp  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0057  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0045  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.240811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0035  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  hitchhiker  0.000468595  normal  0.0532724 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0030  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.237944  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0039  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000294906  hitchhiker  0.000684327 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  85.9 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0032  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00803703  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  96.97 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0053  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000194568  unclonable  8.89969e-24 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0070  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0072  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  0.371186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0075  tRNA-Pro  90.2 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0814813  normal  0.0521466 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0024  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0036  tRNA-Pro  88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0226486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0025    88.24 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.717404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0086  tRNA-Asn  89.13 
 
 		 84 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0041  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0039  tRNA-His  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0312373 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02086  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 1635 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000899057  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0073  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.611784  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0072  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.827056  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00255441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0909  tRNA-Gly  100 
 
 		 78 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.443767  normal  0.830121 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  83.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0028  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0010  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.695097  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0011  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.770603  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0036  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0117844 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0217545 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1545  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0049  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.858771  hitchhiker  0.000592487 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0739  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.158339  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.82132  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1755  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0036  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_R0022  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  44.1  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0015  tRNA-Lys  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0031  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0035  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.928344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000189578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0028  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0006  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000670589  normal  0.608185 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0007  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000264887  normal  0.61678 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0065  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00731054 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_tGly01  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.682857  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1978  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2165  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2245  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 		 777 bp  44.1  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2170  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.105241  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1013  tRNA-Gly  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2253  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.986427  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2331  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0152091  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0057  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0107433  normal  0.396712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0058  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387879  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0561  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  44.1  0.005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1730  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  44.1  0.005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.873105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>