242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_R0035 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0107433  normal  0.396712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0058  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387879  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.928344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  97.18 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  97.18 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  121  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0027  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0277225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60200  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 79 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28740  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230263  hitchhiker  0.00000000587474 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0028  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0791712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  89.7  9e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0033  tRNA-Pro  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00669824  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t57  tRNA-Pro  94.64 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0047  tRNA-Pro  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0052  tRNA-Pro  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0050  tRNA-Pro  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000408942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0069  tRNA-Pro  94.64 
 
 		 77 bp  87.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648758  hitchhiker  0.00241462 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  93.22 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0015  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745885  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0001  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.600067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0069  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0027  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  97.73 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0044  tRNA-Pro  92.45 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  95.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0011  tRNA-Pro  95.45 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192635  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 79 bp  69.9  0.00000000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0036  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.211682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t42  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000750468  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0002  tRNA-Pro  95.24 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0039  tRNA-Pro  88.71 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0042  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.716444  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0071  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000011229  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0010  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t33  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152613  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA40  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  93.18 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R40  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0023  tRNA-Pro  97.22 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  89.06 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  86.76 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3787  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3790  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.336069  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4650  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253318  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4652  tRNA-Pro  89.09 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0301186  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0029  tRNA-Pro  97.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0028  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0254215  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0013  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368769 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0005  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0071  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000628165  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_R0031  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.421646 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0049  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0063  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000266826  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0011  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1901  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0032  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.869887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0049  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.046513  normal  0.505241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0016  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617761  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0027  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192798  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1722  tRNA-Pro  94.44 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181858  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>