249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Pro-1 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0002  tRNA-Pro  95.65 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 79 bp  99.6  9e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0034  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_AR0011  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.192635  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0029  tRNA-Pro  92.75 
 
 		 77 bp  97.6  3e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  94.83 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0050  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0023  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0010  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0042  tRNA-Pro  91.3 
 
 		 77 bp  89.7  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.716444  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_R0028  tRNA-Pro  92.06 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0254215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0107433  normal  0.396712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0058  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387879  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0010  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 78 bp  83.8  0.000000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000000124402  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0028  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.928344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0036  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60200  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03937  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0011  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1901  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0050  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.115332  normal  0.906825 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0032  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.869887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2581  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0434845  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0049  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.046513  normal  0.505241 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0016  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.617761  normal  0.659396 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0044  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.115287  normal  0.132684 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0027  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192798  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0042  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0042  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28740  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230263  hitchhiker  0.00000000587474 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0040  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.310253  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0053  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.763389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0042  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0024  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0021  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1528  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.359619  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0194  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.56004  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0028  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.243939  normal  0.354457 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1722  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.181858  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1745  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.666624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0972  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0531228  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311688  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0018  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0533393  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_667  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198942  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0063  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000332377  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0007  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t57  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0047  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t037  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0007  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.845776 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0027  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0027  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0277225 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0069  tRNA-Pro  88.41 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0033  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0075  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0050  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000408942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0033  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00669824  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0065  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0874306  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0069  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648758  hitchhiker  0.00241462 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0105  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00814632  normal  0.0357368 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0105  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.111925  hitchhiker  0.000305013 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0084  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.39434  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0102  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0499397  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0055  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000197374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0052  tRNA-Pro  97.56 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0055  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t067  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000066415 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0049  tRNA-Pro  89.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00129722  normal  0.854423 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0028  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0791712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0040  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181284  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6001  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0238611 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0044  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151219  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>