100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_R0063 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_R0063  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000266826  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0044  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.408268  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0067  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.912761 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0046  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0243465 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0018  tRNA-Pro  93.88 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.161643  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t57  tRNA-Pro  88.71 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0047  tRNA-Pro  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0527952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0069  tRNA-Pro  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.648758  hitchhiker  0.00241462 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0033  tRNA-Pro  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00669824  normal  0.324624 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0052  tRNA-Pro  88.71 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.208712 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0011  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.497936  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0774  tRNA-Pro  86.3 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.631  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4561  tRNA-Pro  91.84 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315757  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0012  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0043  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.411383 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0002  tRNA-Pro  97.14 
 
 
77 bp  61.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28740  tRNA-Pro  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000230263  hitchhiker  0.00000000587474 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t10  tRNA-Pro  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0829003  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0027  tRNA-Pro  87.1 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0277225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  87.93 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2512  tRNA-Pro  87.1 
 
 
79 bp  60  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.899251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60200  tRNA-Pro  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0010  tRNA-Pro  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.173573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0069  tRNA-Pro  87.1 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.372254  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0031  tRNA-Pro  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.418817  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1407  tRNA-Pro  89.8 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00146012  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0028  tRNA-Pro  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0035  tRNA-Pro  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.928344  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0057  tRNA-Pro  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0107433  normal  0.396712 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0058  tRNA-Pro  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.387879  normal  0.0550835 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1470  tRNA-Pro  89.8 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.203252  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0036  tRNA-Pro  88.68 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.067402 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0042  tRNA-Pro  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.716444  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0051  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0010  tRNA-Pro  92.5 
 
 
77 bp  56  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.583908 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0015  tRNA-Pro  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0042  tRNA-Pro  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.888445  hitchhiker  0.00955476 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0026  tRNA-Pro  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.122397  normal  0.206056 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0005  tRNA-Pro  90.7 
 
 
77 bp  54  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0044  tRNA-Pro  92.31 
 
 
77 bp  54  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000151219  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_667  tRNA-Pro  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198942  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311688  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0018  tRNA-Pro  90.48 
 
 
77 bp  52  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0533393  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0008  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0049  tRNA-Pro  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.106855  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  87.76 
 
 
77 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0009  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0009  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.687606  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0009  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.565399  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0034  tRNA-Pro  87.76 
 
 
74 bp  50.1  0.00008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0069  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0064  tRNA-Arg  100 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0035  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00000571794  hitchhiker  0.0000531069 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0056  tRNA-Pro  96.43 
 
 
77 bp  48.1  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0029  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0027  tRNA-Pro  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.43 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA40  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82087  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R40  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.681358  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0534  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.101652  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0013  tRNA-Pro  93.55 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  88.37 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  88.37 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0039  tRNA-Pro  96.3 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000294906  hitchhiker  0.000684327 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t33  tRNA-Pro  89.74 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.152613  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0003  tRNA-Pro  88.1 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.769558  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0012  tRNA-Pro  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0029  tRNA-Pro  93.33 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.115718 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  96.15 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0053  tRNA-Pro  96.15 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.379391  normal  0.108356 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0015  tRNA-Pro  93.33 
 
 
74 bp  44.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.745885  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  84.48 
 
 
77 bp  44.1  0.005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>