14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_R0032 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 78 bp  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00803703  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4331  tRNA-Pro  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.521695  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0021  tRNA-Pro  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.162595 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0028  tRNA-Pro  98.72 
 
 		 78 bp  147  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.64195  normal  0.970815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0013  tRNA-Pro  95.12 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.959732  normal  0.117453 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0017  tRNA-Pro  95.12 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0032  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 78 bp  58  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0580782  normal  0.580774 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6030  tRNA-Pro  95.12 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.285404  normal  0.189385 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  95.12 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0040  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.181284  normal  0.105985 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0033  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.614973  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>