298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_R0033 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0281324  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19810  tRNA-Pro  98.65 
 
 
77 bp  139  1e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0041  tRNA-Pro  97.3 
 
 
77 bp  131  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0029  tRNA-Pro  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0677736  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0029  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.396369  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23920  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106953  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  95.95 
 
 
77 bp  123  6e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14021  tRNA-Pro  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  96.72 
 
 
74 bp  105  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0032  tRNA-Pro  96.72 
 
 
77 bp  105  1e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  96.55 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0043  tRNA-Pro  95.08 
 
 
74 bp  97.6  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390511  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  93.44 
 
 
77 bp  89.7  8e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  93.44 
 
 
77 bp  89.7  8e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  93.44 
 
 
77 bp  89.7  8e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0027  tRNA-Pro  94.74 
 
 
77 bp  89.7  8e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09740  tRNA-Pro  93.22 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.843645 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  92.06 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0029  tRNA-Pro  89.19 
 
 
77 bp  83.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  94.44 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  92.98 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4561  tRNA-Pro  92.86 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315757  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0035  tRNA-Pro  89.33 
 
 
78 bp  77.8  0.0000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  90.48 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0003  tRNA-Pro  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.769558  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0050  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_667  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198942  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0018  tRNA-Pro  87.84 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0533393  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0034  tRNA-Pro  91.23 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  88.89 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6001  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0238611 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  86.49 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5733  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  88.52 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  88.52 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  88.52 
 
 
80 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000195724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0020  tRNA-Pro  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0030  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0033  tRNA-Pro  89.47 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273821  hitchhiker  0.000950715 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401442  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000342912  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5812  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000461866  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0025  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0259954  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5640  tRNA-Pro  88.52 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.108099  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  88.52 
 
 
79 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  88.52 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5027  tRNA-Pro  88.52 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000593186  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>