296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_R0032 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_R0032  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  109  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0043  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390511  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0033  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0281324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  96.72 
 
 		 77 bp  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19810  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0041  tRNA-Pro  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  6e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  9e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  93.44 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0020  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.951008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0003  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.769558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0029  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.396369  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0029  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0677736  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  93.1 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23920  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106953  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  91.8 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4561  tRNA-Pro  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.315757  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0038  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0023  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.310662  normal  0.736236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0034  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.139468  normal  0.191079 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0027  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14021  tRNA-Pro  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0056  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09740  tRNA-Pro  89.83 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.843645 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0025  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0039  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.500451  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0008  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0152664  normal  0.709195 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0035  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0001  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0020  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0033  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273821  hitchhiker  0.000950715 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0030  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 80 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0017  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0061005  normal  0.238616 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0039  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000242706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0052  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0018  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.452658 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0044  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0011  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0050  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0012  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0290089 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0011  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5695  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000661366  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5725  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000708731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0007424  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000658436  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.353859  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000771561  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0786  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.39935e-31 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000391226  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0026  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0136  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00336688  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0102  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 79 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160817  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0861  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0105  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000482088  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0219  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000281593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4570  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000623661  normal  0.109465 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0025  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0258602  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0101  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00179656  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4996  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0132  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000929612  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>