203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_R0049 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0541281  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0049  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.925267  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna31  tRNA-Pro  96.1 
 
 		 77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.184408  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0026  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0070  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0075  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0814813  normal  0.0521466 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0072  tRNA-Pro  90 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.46213  normal  0.371186 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0057  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0005  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.043428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0022  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000263342  normal  0.454307 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0030    85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0163482  normal  0.16826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  86.3 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0040  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0033  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.923916  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0025  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.692455  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA20  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0493048 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0039  tRNA-Pro  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000294906  hitchhiker  0.000684327 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0032  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0056  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0028  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0791712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0004  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.14749  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0039  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000242706 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0044  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0007  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73016 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0052  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0030  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0641219  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0311688  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0009  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0164  tRNA-Pro  94.29 
 
 		 79 bp  54  0.000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_667  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0198942  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0057  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.600099  normal  0.289188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0067  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_R0018  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0533393  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0040  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.312824  normal  0.312711 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0330229  normal  0.370598 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0076  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.77205  normal  0.0987165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0087  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0012  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0057  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0014  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.267148 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0018  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.471036  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Pro-2  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt38  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt38  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0023  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309349  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.719402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0020  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309076  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309142  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165714  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAProVIMSS1309195  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.0101473 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0035  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0052  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0019  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309152  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0039  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.500451  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19810  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0060  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0545385 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA40  tRNA-Pro  88.37 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0135525  normal  0.0275356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  96.3 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t20  tRNA-Met  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2609  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.181156  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t027  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t028  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0027  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00912814 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R21  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.69623  normal  0.0537905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R22  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.691198  normal  0.0547786 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0067  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0631311  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0077  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0627424  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0071  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000011229  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0056  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0057  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0041  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0248017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0038  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.161096  normal  0.940796 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0074  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000142028  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0075  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000125348  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0076  tRNA-Met  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000117195  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>