92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_R0029 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_R0029  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15480  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.837894  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0041  tRNA-Pro  89.33 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0033  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0281324  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19810  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15160  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00584084  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23920  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106953  normal  0.110319 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0033  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0127395 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0044  tRNA-Pro  86.84 
 
 		 77 bp  71.9  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0158567  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0032  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.601376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14021  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0097  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.96402 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0032  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0032  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00831776  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0024  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0559967  normal  0.0473979 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06390  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284201  normal  0.0452079 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0030  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000286797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0030  tRNA-Pro  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0029  tRNA-Pro  85.53 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0677736  normal  0.092097 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0024  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.253292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0021  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0018  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0018  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal  0.12762 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0037  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.146864 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0056  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0029  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.396369  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0026  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.422663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0032  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230593  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0031  tRNA-Pro  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0616283  decreased coverage  0.00565268 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  84.42 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1627  tRNA-Pro  84.93 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000100437  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  96.88 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0050  tRNA-Pro  94.29 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0166899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0043  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0170855  normal  0.349798 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0043  tRNA-Pro  85.25 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.390511  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0013  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.793081  normal  0.281432 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0035  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1483  tRNA-Pro  83.82 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.155971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0009  tRNA-Pro  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.152729 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0034  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 78 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000537169  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0027  tRNA-Pro  83.82 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000372611  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  93.75 
 
 		 77 bp  48.1  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4243  tRNA-Pro  83.82 
 
 		 79 bp  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.421739  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0108  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0019  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000160288  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0052  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000784073  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000792885  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0035  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0052  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144248  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0002  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000768997  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0300  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000871515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5673  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000105967  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5043  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000247128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0278  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5665  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000462002  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Pro-4  tRNA-Pro  91.43 
 
 		 80 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000117481  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_006368  lppt08  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt08  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0026  tRNA-Pro  91.18 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0025  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.303399 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0038  tRNA-Ala  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.882256  normal  0.801232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0033  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.273821  hitchhiker  0.000950715 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0017  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0599655  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0028  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.897252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0038  tRNA-Ile  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00492352  normal  0.805671 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  96.15 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_R0037  tRNA-Pro  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  1.47899e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11950  tRNA-Pro  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.883276 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0022  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  44.1  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000414073  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>