112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_36270 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0057  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0011  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0269347  normal  0.199214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0006  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0061  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.273453  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0051  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0054  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.190136  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0051  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0997799  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0057  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0052  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.330689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0050  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.134805  hitchhiker  0.00793111 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14040  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0988532 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0007  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 77 bp  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0101042 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0010  tRNA-Pro  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_R0075  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25920  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 77 bp  99.6  9e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0073  tRNA-Pro  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0057  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0059  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 77 bp  91.7  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.193941 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0010  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0007  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.73016 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0010  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04840  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.51586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0057  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 77 bp  83.8  0.000000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0007  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.929508 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0012  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0010  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152064  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0005  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.240002  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0052  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00000162603  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03900  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.319325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0015  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11205  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0042  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0060  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0058  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t27  tRNA-Pro  87.84 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0120151  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0050  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0009  tRNA-Pro  87.14 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_R0094  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1369  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0019  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000100673  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0034  tRNA-Pro  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.870471  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0028  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.988711  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0032  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0312905  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0035  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000987265  normal  0.0118441 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0034  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00129809  normal  0.24129 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0030  tRNA-Pro  86.49 
 
 		 73 bp  60  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0071  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0705665  normal  0.183777 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t42  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00000750468  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0044  tRNA-Pro  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0044  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.180839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0026  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0046  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0117293  normal  0.0116525 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0044  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00846239  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0011  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0004  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.14749  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0032  tRNA-Pro  85.14 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24870  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1637  tRNA-Pro  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.590858  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0001  tRNA-Pro  84.29 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.170167  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2126  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0006  tRNA-Pro  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60110  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26300  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0012  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.488167  normal  0.183255 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0016  tRNA-Pro  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0042  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0064  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0016  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  unclonable  0.0000000335758  normal  0.0133368 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0053  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00100217  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0026  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  50.1  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0020  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0058  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.390134  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAProVIMSS1309076  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAProVIMSS1309142  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.165714  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAProVIMSS1309295  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339192 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAProVIMSS1309152  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAProVIMSS1309349  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.521011 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0049  tRNA-Pro  93.55 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0016  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0033  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00710383  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0050  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0051  tRNA-Pro  84.13 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0012  tRNA-Pro  84.75 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.189557  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0015  tRNA-Pro  83.58 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0316324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0020  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>