197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_R0023 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_R0023  tRNA-Pro  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000446356  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0089  tRNA-Pro  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.62711e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0018  tRNA-Pro  95.08 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.767214  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0051  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0089  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000619101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0018  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0036  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0030  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000233844  normal  0.0418304 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0028  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 77 bp  79.8  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0020  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.130246  normal  0.018662 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0066  tRNA-Pro  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000000715268  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0049  tRNA-Pro  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.757916 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4313  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0785  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.571174  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0020  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0219771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0044  tRNA-Pro  88.57 
 
 		 77 bp  75.8  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.261582 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0680  tRNA-Pro  91.38 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0731401  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt25  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt25  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0015  tRNA-Pro  91.23 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.523292  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  87.01 
 
 		 77 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0056  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000452415  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0016  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0128175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0045  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0011  tRNA-Pro  91.07 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna46  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0006  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.715735  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0029  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 78 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0032  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0025005  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0057  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0049  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.197597  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0051  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0019  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0928705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0063  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.870767  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0057  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0017  tRNA-Pro  87.32 
 
 		 77 bp  69.9  0.00000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.334126  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0051  tRNA-Pro  95.35 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14020  tRNA-Pro  89.66 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0036  tRNA-Pro  92 
 
 		 77 bp  67.9  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00692633  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0022  tRNA-Pro  92.59 
 
 		 78 bp  67.9  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.912815  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_R0014  tRNA-Pro  90.74 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0013  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000629989  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0022  tRNA-Pro  89.47 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000445739  unclonable  9.38504e-19 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0085  tRNA-Pro  85.71 
 
 		 77 bp  65.9  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000032412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0013  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368769 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1378  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0049  tRNA-Pro  89.29 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0031  tRNA-Pro  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000153307  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0031  tRNA-Pro  90.38 
 
 		 77 bp  63.9  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000674228  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PGt16  tRNA-Pro  91.49 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0040  tRNA-Pro  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0475845  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  87.3 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0039  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0035  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000197485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12440  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0057  tRNA-Pro  88.89 
 
 		 74 bp  60  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0022  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.283237  normal  0.256821 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0037  tRNA-Pro  88.68 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000230593  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0016  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0026  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0018  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0067  tRNA-Pro  88.33 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.588797  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0030  tRNA-Pro  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000324054  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0042  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.010895  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0041  tRNA-Pro  88.33 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.83752 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0008  tRNA-Pro  86.67 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  85.29 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R82  tRNA-Pro  86.44 
 
 		 77 bp  54  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000106099  normal  0.132387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0026  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.094878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0035  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.877859  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0021  tRNA-Pro  87.93 
 
 		 78 bp  52  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0056  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.715456  normal  0.81728 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0040  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_R0001  tRNA-Pro  86.21 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0026  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174672  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0047  tRNA-Pro  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0344434  hitchhiker  0.0000000497357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  90.48 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0493619  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36270  tRNA-Pro  100 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.973598 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0009  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000000618395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0017  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t40  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000171726  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0034  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.199678  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0035  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000101815  hitchhiker  0.00514496 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0043  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 76 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.025713  normal  0.877407 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0033  tRNA-Pro  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.216286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0043  tRNA-Pro  87.72 
 
 		 75 bp  50.1  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0225474  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0033  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.981305 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0019  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  unclonable  0.00000000077385  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0026  tRNA-Pro  91.11 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.358693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0046  tRNA-Pro  93.94 
 
 		 73 bp  50.1  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.000000000000003033  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0004  tRNA-Pro  85.96 
 
 		 78 bp  50.1  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0011  tRNA-Pro  83.12 
 
 		 77 bp  50.1  0.00008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.11857  normal  0.0548204 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>