299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHAB381_1418 on replicon NC_009714
Organism: Campylobacter hominis ATCC BAA-381



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  100 
 
 		 79 bp  157  5.0000000000000005e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  95.89 
 
 		 77 bp  121  3e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  95.77 
 
 		 77 bp  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2135  tRNA-Pro  95.95 
 
 		 78 bp  115  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00369966  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  93.51 
 
 		 77 bp  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2210  tRNA-Pro  94.59 
 
 		 78 bp  107  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.225115  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0036  tRNA-Pro  94.12 
 
 		 77 bp  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.37965 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  92.96 
 
 		 77 bp  101  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0027  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.417259 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0026  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00524532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0028  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0102349  hitchhiker  0.000264147 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0035  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000578249  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0032  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994624  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4569  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0425443  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  90.91 
 
 		 77 bp  97.6  4e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  89.61 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  94.74 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  90.41 
 
 		 77 bp  89.7  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  91.67 
 
 		 78 bp  87.7  3e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_R0063  tRNA-Pro  96.08 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  90.14 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0049  tRNA-Pro  94.55 
 
 		 77 bp  85.7  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0003  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.308325  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0144  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000613621  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0016  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000188121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0122  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00712397  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0027  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000324929  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0103  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727228  decreased coverage  0.000000214334 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0028  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00514358  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t024  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t097  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t098  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0048  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000100606  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0089  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000343709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0017  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000587442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0026  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000193021  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0046  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000453767  hitchhiker  0.0000828502 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0016  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0142  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.130336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t001  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0141  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.122826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0123  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0167093  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0116  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.145812  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0117  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.196066  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t107  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t098  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000663033  normal  0.0932756 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0038  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000899293  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0142  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00432211  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0027  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00246876  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0022  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000205462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0023  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000214609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0117  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000471019  normal  0.0136219 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0117  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000010533  normal  0.0493795 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0134  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000115424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0135  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000102707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0130  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0131  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  89.04 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0022  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00394486  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0023  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00847785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0114  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000342233  normal  0.573602 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0017  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0143  tRNA-Pro  92.98 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00160739  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  88.31 
 
 		 77 bp  81.8  0.00000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3099t  tRNA-Pro  92.86 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000107843  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>