298 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BARBAKC583_0768 on replicon NC_008783
Organism: Bartonella bacilliformis KC583



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0768  tRNA-Pro  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.28458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Pro-3  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.592302  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1531  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.47488  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1501  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.287153  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0032  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.832737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1702  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.535582  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2759  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0341238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0034  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.450402 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0024  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0711  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0590  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.532151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0039  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00372537  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0039  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0039  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.266264  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0037  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448716  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1308  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.585322  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0050  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0840957  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0562  tRNA-Pro  96.1 
 
 
77 bp  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.60431  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t08  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.657243  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0047  tRNA-Pro  95.95 
 
 
74 bp  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290911  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0052  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.375643  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0047  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0039  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0435386 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0035  tRNA-Pro  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4244  normal  0.758764 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0066  tRNA-Pro  95.59 
 
 
77 bp  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.060249  normal  0.806885 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0032  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0002  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4311  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0041  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0010  tRNA-Pro  92.21 
 
 
77 bp  105  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.475805  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0062  tRNA-Pro  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0059  tRNA-Pro  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.867475 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0057  tRNA-Pro  92.96 
 
 
77 bp  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.125773  normal  0.0397591 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0064  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  97.6  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0046  tRNA-Pro  91.89 
 
 
78 bp  91.7  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0007  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000164382  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1654  tRNA-OTHER  97.96 
 
 
75 bp  89.7  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000253877  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0008  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00816895  normal  0.604163 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0017  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0047  tRNA-Pro  89.61 
 
 
77 bp  89.7  9e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000442161  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0016  tRNA-Pro  90.14 
 
 
77 bp  85.7  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0504484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0036  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00692633  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Pro-1  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RS03760  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0394187 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0048  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.793007 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1454  tRNA-Pro  88.31 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00328023  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0032  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0025  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0002  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.815773  normal  0.273413 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1418  tRNA-Pro  88.31 
 
 
79 bp  81.8  0.00000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0051  tRNA-Pro  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.293622  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2326  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.261307  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0036  tRNA-Pro  89.04 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0031  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0035  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000578249  normal  0.604017 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0011  tRNA-Pro  89.71 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.253488 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0023  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.247258  normal  0.475897 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0032  tRNA-Pro  90.62 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.994624  normal  0.886645 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0007  tRNA-Pro  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0007  tRNA-Pro  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.845776 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0018  tRNA-Pro  88.73 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.021826  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6001  tRNA-Pro  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0238611 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_R0014  tRNA-Pro  89.19 
 
 
78 bp  75.8  0.000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000480713  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0041  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0041  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.0647014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0011  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.162478  normal  0.385967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0065  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000795587  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2606  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.834732  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0051  tRNA-Pro  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.659123  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0053  tRNA-OTHER  93.88 
 
 
72 bp  73.8  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0012  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0142147 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0013  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00368769 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0188  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.320411  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0049  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0021  tRNA-Pro  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0017  tRNA-Pro  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0001  tRNA-Pro  90.91 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro01  tRNA-Pro  87.32 
 
 
80 bp  69.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.0000000000413507  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tPro02  tRNA-Pro  87.32 
 
 
80 bp  69.9  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00984668  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0004  tRNA-Pro  89.83 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0133436 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0056  tRNA-Pro  87.32 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198324  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0035  tRNA-Pro  87.32 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0637572  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0615  tRNA-Pro  88.89 
 
 
77 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.394292  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0047  tRNA-Pro  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PGt16  tRNA-Pro  91.38 
 
 
78 bp  67.9  0.0000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t02  tRNA-Pro  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143246  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0012  tRNA-Pro  90.74 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00369197  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0022  tRNA-Pro  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.367488  normal  0.0190369 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0019  tRNA-Pro  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000000286409  normal  0.184276 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0041  tRNA-Pro  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0248017  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0037  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0051  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0059  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0493454  normal  0.0177961 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0040  tRNA-Pro  86.3 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000256829  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0036  tRNA-Pro  93.33 
 
 
73 bp  65.9  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0614485  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0019  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0048  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.255642  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0098  tRNA-Pro  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.266439  normal  0.536301 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0118  tRNA-Pro  89.47 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0573912  normal  0.387892 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0022  tRNA-Pro  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>