148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_t1545 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_t1538  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1545  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  3.87406e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0016  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363551  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0053  tRNA-Gln  93.06 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000068806  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0236  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0012758  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t1924  tRNA-Gln  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00590264  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_R0004  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  1.40819e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1622  tRNA-Gln  91.84 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000113054  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1592  tRNA-Gln  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000946426  normal  0.766163 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0611  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000107562  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0855  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000488484  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0172  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0373789 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5652  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000646012  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5661  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000728677  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5682  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0259032  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5689  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000231453  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00187626  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000184976  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000158624  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000198835  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0951866  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  4.75916e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000252021  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0262249  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000616644  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000069751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000190168  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5727  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000826776  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000964949  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000106014  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000553  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000160535  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0419  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0333429  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  89.09 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0296  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000266549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0193  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000238459  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0064  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0165002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0038  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000497098  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0047  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000522107  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0085  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000545364  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0095  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000269172  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5717  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00280638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5669  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000100542  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5143  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000037642  normal  0.817541 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0045  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000078833  normal  0.0156907 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0046  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000171717  normal  0.0156007 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0095  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0038  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.258408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0048  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000232523  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0089  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0127178  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0099  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000157171  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5047  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000895408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4766  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000101548  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4576  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0809637 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5655  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0780  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.63949e-30 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0032  tRNA-Gln  87.3 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000363695  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0536  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34797e-32 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0274  tRNA-Gln  85.92 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0168  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0008  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.629298  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0008  tRNA-Gln  90.74 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.112331  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4559  tRNA-Gln  89.29 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0047  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.907945  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1847  tRNA-Gln  88.33 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 77 bp  56  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0046  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000115177  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0038  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.218666  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000150139  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-2  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000169355  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-3  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.926343  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gln-4  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0088  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000264747  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0017  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000220842  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0829  tRNA-Gln  85.71 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00000799298  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t1806  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000098323  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t2564  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0093  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0638  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00000166232  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t1386  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000259699  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0019  tRNA-Gln  96.77 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.349932  normal  0.647835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0032  tRNA-Gln  84.51 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0017  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0205795  normal  0.59199 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0107  tRNA-Gln  84.85 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>