182 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_60290 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_t18  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3091  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t54  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0869713 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t18  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0067  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.963096  normal  0.0255259 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA19  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.488771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R46  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856686  normal  0.887396 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R75  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0688488  normal  0.384971 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5319  tRNA-Gln  100 
 
 		 77 bp  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.11036  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60290  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184905  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61760  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.486139  hitchhiker  0.00483017 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60300  tRNA-Gln  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18805  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0033  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0044  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.275376 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0070  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.374652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0014  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.474255  normal  0.24378 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0015  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.365427  normal  0.400071 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0029  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0055  tRNA-Gln  100 
 
 		 75 bp  143  6e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4346  tRNA-Gln  91.3 
 
 		 75 bp  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.850854  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4327  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0023  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0444305  normal  0.71139 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0021  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0591367 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0022  tRNA-Gln  89.86 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.827155  normal  0.0599368 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0036  tRNA-Gln  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0046  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  6.53716e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0001  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.275531 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0048  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0051  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00516636  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_R0052  tRNA-Gln  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00572206  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0032  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.00000308987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0066  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0081  tRNA-Gln  86.96 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000262166  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0005  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00725713 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0006  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0070986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0049  tRNA-Gln  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.296013  normal  0.0255901 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0006  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00260818  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0007  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00716985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0074  tRNA-Gln  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000739317  normal  0.0440793 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0053  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000336503  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0054  tRNA-Gln  91.67 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000300359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0070  tRNA-Gln  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000111082  normal  0.043537 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0072  tRNA-Gln  90.38 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000124926  normal  0.0423905 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna3  tRNA-Gln  86.49 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.491814  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4257  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.43895e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0061  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0270894  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4258  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 77 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.53905e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0029  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.245905  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0330  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000145086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0031  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000750254  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0030  tRNA-Gln  88.89 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000771762  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0030  tRNA-Gln  94.74 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0007  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.791549  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t06  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0064  tRNA-Gln  94.59 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.00065623  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0006  tRNA-Gln  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.404831 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0051  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0001  tRNA-Gln  86.89 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0515  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0014  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.349887  normal  0.140973 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0008  tRNA-Gln  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.970868  normal  0.737558 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna145  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000913211  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna139  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000807662  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna134  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000841901  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna141  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000824514  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0038  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0011  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_R0005  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000119132  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0037  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0225857  normal  0.764291 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0008  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01241  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01235  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlnVIMSS1309367  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0101  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000260011  normal  0.104999 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0103  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000561751  normal  0.100638 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0104  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000537672  normal  0.102798 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna137  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000774984  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0048  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.509197 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna150  tRNA-Gln  87.5 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000104181  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0012  tRNA-Gln  88.46 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.376695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0007  tRNA-Gln  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.102252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0037  tRNA-Gln  88.73 
 
 		 76 bp  54  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000269489  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0055  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000526045  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0055  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00371124  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0014  tRNA-Gln  85.14 
 
 		 77 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323389  normal  0.291127 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1766  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000182708  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1769  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157848  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1775  tRNA-Gln  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000331102  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3565  tRNA-Gln  96.67 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Gln-1  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t016  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t017  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t020  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0034  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495722  normal  0.146061 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0035  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000023217  normal  0.116994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0036  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000579663  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0039  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000688787  normal  0.114963 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0033  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000210301  normal  0.0264572 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0034  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000257252  normal  0.0258068 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0037  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000116845  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0605  tRNA-Gln  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>