More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_R0032 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  97.3 
 
 
74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  93.24 
 
 
74 bp  107  4e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  93.15 
 
 
74 bp  105  1e-21  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  92.96 
 
 
71 bp  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  92.96 
 
 
71 bp  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  92.96 
 
 
71 bp  101  2e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  91.89 
 
 
74 bp  99.6  9e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  91.78 
 
 
75 bp  97.6  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  91.78 
 
 
74 bp  97.6  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  91.43 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  90.54 
 
 
74 bp  91.7  2e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  90.41 
 
 
74 bp  89.7  8e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  89.19 
 
 
74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  89.04 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  89.04 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  89.04 
 
 
74 bp  81.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lppt10  tRNA-Gly  88.89 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt10  tRNA-Gly  88.89 
 
 
74 bp  79.8  0.00000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1005  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000280162  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1135  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0276183  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  97.67 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0030  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0538391 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  87.84 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>