More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_09150 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  95.95 
 
 		 74 bp  123  6e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  94.52 
 
 		 74 bp  113  6e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0062  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25240  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0004  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.017851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0007  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0013  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.218787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35500  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1872  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0196085  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0318  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 75 bp  97.6  3e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000203347  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0067  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.294367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0011  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0080  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.12182 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0154  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693037  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0008  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  0.0304222 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0011  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511847  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0150  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000645582  hitchhiker  0.00000000139269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0015  tRNA-Gly  93.44 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000368729  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0028  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0059  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0075  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.300561  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0062  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000000596481  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>