108 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_R0029 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  143  6e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  95.31 
 
 		 72 bp  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0046  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 72 bp  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316882 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  92.59 
 
 		 72 bp  75.8  0.000000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  94 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  91.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  95.12 
 
 		 72 bp  65.9  0.000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  89.47 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t0781  tRNA-Gly  97.14 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0621969  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  90 
 
 		 72 bp  60  0.00000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 75 bp  60  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 72 bp  54  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0048  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 72 bp  52  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0003  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760714  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  86.79 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  85.25 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0034  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0037  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0004  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.298901  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_R0039  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 75 bp  48.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0030  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.554651 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0027  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.012963  normal  0.0666996 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0049  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000536409  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2515  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2525  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000865266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2628  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2219  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000214695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2229  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2314  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1225  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.199652  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0039  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.433295  normal  0.207379 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0082  tRNA-His  100 
 
 		 77 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000305827  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0096  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.0000270279  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4200  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.1543e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0004  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000344826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0526  tRNA-His  100 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000639476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0043  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0173086  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0032  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.520916  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0002  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.168661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0009  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000412211  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_R0090  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.000216717  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0018  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 73 bp  46.1  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.746026  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0088  tRNA-His  100 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  86.27 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0016  tRNA-His  96.15 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.33811 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>