200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_R0054 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4296  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.514839  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_4344  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0932654  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0049  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0017  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.432815  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_R0029  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.649765  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_R0023  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_R0047  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 75 bp  109  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.722029  normal  0.0798457 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6044  tRNA-Gly  90.67 
 
 		 75 bp  93.7  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 72 bp  81.8  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  94.34 
 
 		 75 bp  81.8  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0070  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0029  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.122456  normal  0.962051 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0033  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.548624 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0034  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.558867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0035  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.566627 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0002  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.385644 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0055  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.138155  hitchhiker  0.00896758 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  89.23 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  92.45 
 
 		 72 bp  73.8  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0026  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.672407  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0044  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110849  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309069  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309120  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.15103  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309187  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309145  tRNA-Gly  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.732505  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0055  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623163  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 73 bp  65.9  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0046  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 72 bp  63.9  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316882 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  86.84 
 
 		 76 bp  63.9  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0005  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0042  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0021  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000205707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0023  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000000000214158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4576  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0007  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0046  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0029  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 73 bp  60  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0035  tRNA-Gly  91.3 
 
 		 72 bp  60  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0002  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.231907  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0002  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0010  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00274853 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0041  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.297349  decreased coverage  0.00434413 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0061  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.677288 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309363  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1789  tRNA-Gly  85.29 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.212776  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309288  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0313014 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0025  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0001    84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0451223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0063  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.333603 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0004  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.54255  normal  0.0153905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0014  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.854137  normal  0.0928806 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0054  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.290496  normal  0.747562 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0059  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.07343  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2155  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.903819  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0060  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000000635466  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1866  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0037  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0005  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118248  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0024  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.113773  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_R0060  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.18005  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0052  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.165358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0015  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.409791  hitchhiker  0.00133566 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 76 bp  54  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>