More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0085 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0030  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0059  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000336039  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0281  tRNA-Gly  100 
 
 
75 bp  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000381106  hitchhiker  0.0000254958 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1578  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1613  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.610826 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0026  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_t0170  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0085  tRNA-Gly  100 
 
 
72 bp  143  6e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000120136  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000588237  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  97.22 
 
 
75 bp  127  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0050  tRNA-Gly  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0105  tRNA-Gly  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.904682  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0094  tRNA-Gly  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022711  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0021  tRNA-Gly  95.83 
 
 
75 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101366  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0040  tRNA-Gly  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0631602  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0068  tRNA-Gly  95.83 
 
 
75 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00365529  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0034  tRNA-Gly  95.83 
 
 
72 bp  119  9e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0112  tRNA-Gly  94.44 
 
 
72 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0018  tRNA-Gly  94.44 
 
 
75 bp  111  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4999  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5654  tRNA-Gly  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000615914  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5683  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0251422  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5692  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000815905  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5728  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000760665  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0135  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000405897  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000301735  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000299273  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000174679  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00746864  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000472811  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.34208  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000445849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-9  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0690974  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000170652  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000219047  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000721816  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  93.06 
 
 
78 bp  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0273307  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5637  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116083  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5657  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000792898  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0612  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000121451  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5730  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000092576  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0102  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000562923  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0022  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0110394  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0090  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124238  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000814589  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000594127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000138303  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000064552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0086  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534948  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4765  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000105314  hitchhiker  8.34658e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0783  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.7717399999999996e-31 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0174  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0677947 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5718  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00273939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0537  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.26138e-32 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0195  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000704358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0099  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152408  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0040  tRNA-Gly  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.634702  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5815  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000650347  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0216  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000219569  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4573  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.110089 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0139  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00889637  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5030  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000514384  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0022  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00428299  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0040  tRNA-Gly  93.06 
 
 
72 bp  103  5e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000910792  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0858  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0078  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5141  tRNA-Gly  93.06 
 
 
75 bp  103  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000127094  normal  0.806107 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0028  tRNA-Gly  96.61 
 
 
72 bp  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000877648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0177  tRNA-Gly  96.61 
 
 
72 bp  101  2e-20  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1225  tRNA-Gly  96.49 
 
 
72 bp  97.6  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.199652  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0098  tRNA-Gly  91.67 
 
 
75 bp  95.6  1e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00020662  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  94.92 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  94.92 
 
 
72 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0612672  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  93.44 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  93.44 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  93.44 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0019  tRNA-Gly  94.74 
 
 
73 bp  89.7  8e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  93.44 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  93.44 
 
 
75 bp  89.7  8e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  93.44 
 
 
72 bp  89.7  8e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0006  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.588385  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0040  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000154862  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0036  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0070  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.361889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0042  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000166139  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0037  tRNA-Gly  90.28 
 
 
75 bp  87.7  3e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000985709  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0058  tRNA-Gly  90.77 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.585582  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0027  tRNA-Gly  92.98 
 
 
76 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0028  tRNA-Gly  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0043  tRNA-Gly  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00050261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0031  tRNA-Gly  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000337509 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0028  tRNA-Gly  92.98 
 
 
73 bp  81.8  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.179764  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0058  tRNA-Gly  90.77 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0012  tRNA-Gly  90.77 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000023664  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0012  tRNA-Gly  90.77 
 
 
75 bp  81.8  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.00000000311563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>