129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_R0027 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133114  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0001  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0055  tRNA-Gly  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.623163  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0014  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000685902  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0037  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000929008  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0052  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000418671  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0030  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0009  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0007  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_R0006  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 75 bp  87.7  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0017  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000137246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0012  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00000602687  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0009  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.000000000199446  normal  0.87079 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0013  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 75 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0041  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 72 bp  79.8  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2155  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.903819  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1866  tRNA-Gly  92.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0046  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 75 bp  75.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0040  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.346214  normal  0.248839 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0046  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000231748  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0048  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000268025  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_R0050  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000555856  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0009  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0036  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0039  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0041  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.689762 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0031  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000377899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0001  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.155271 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0003  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100529 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_R0005  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.104558 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0038  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.657012 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0019  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0021  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.953121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2515  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0285567  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2525  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000865266  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2628  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2219  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000214695  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2229  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000227331  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2314  tRNA-Gly  93.48 
 
 		 75 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0054  tRNA-Gly  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.308145  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0024  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.664304  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0025  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.89126  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_R0035  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000144039  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0028  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.500637 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0036  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0020  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0047  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0323697  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0048  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0038  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.697108 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0043  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0040  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0045  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.356708  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0017  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0063  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.131328  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0066  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0017  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0026  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0028  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.30863e-30 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000495704  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0040  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0861757  normal  0.0439849 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0041  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000613233  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0043  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000000854209  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0070  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00981637  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0048  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1458  tRNA-Val  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.0000874188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0044  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0626  tRNA-Gly  90.57 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00428468  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10740  tRNA-Gly  89.8 
 
 		 77 bp  58  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.0089339  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0062  tRNA-Gly  86.15 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000167826  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0030  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000022612  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0053  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_R0024  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0035  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.724762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0038  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259846  hitchhiker  0.000504235 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0030  tRNA-Gly  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403555 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0044  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.108076  normal  0.0172925 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0046  tRNA-Gly  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0354159  normal  0.0175465 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0038  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0034  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.371143  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0037  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.382457  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16780  tRNA-Gly  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.189854  normal  0.0581004 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16750  tRNA-Gly  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190541  normal  0.0593144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0041  tRNA-Gly  88 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0179504  normal  0.583011 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0035  tRNA-Gly  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.443699  normal  0.0257466 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0043  tRNA-Gly  88 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0622835 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0085  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0056  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000000515386  normal  0.717167 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0032  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0192134 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0032  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000809268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0035  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 73 bp  52  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000926277 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10770  tRNA-Gly  92.11 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.029864  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.850399  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0046  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 72 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000316882 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0241  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0020  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0370755  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0024  tRNA-Gly  87.76 
 
 		 73 bp  50.1  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0474961  hitchhiker  0.000422709 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0026  tRNA-Gly  84.62 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.319297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>