47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_R0047 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_R0047  tRNA-Gly  100 
 
 		 77 bp  153  7e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.231132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0039  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.52973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0032  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  101  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0003  tRNA-Gly  93.88 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760714  normal  0.382558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  91.84 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0008  tRNA-Gly  96.97 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.612025 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0001  tRNA-Gly  89.58 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0149399  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90 
 
 		 75 bp  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0007  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.864337  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309271  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309207  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 72 bp  50.1  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309383  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00120568 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0022  tRNA-Gly  100 
 
 		 73 bp  48.1  0.0003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0368562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0036  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0014  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0037  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_R0013  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0001  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0014  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.288772  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_R0037  tRNA-Ala  93.55 
 
 		 76 bp  46.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  88 
 
 		 74 bp  44.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0004  tRNA-Gly  88.1 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0029  tRNA-Ala  100 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000441768  normal  0.0859577 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_R0058  tRNA-Gly  86 
 
 		 76 bp  44.1  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>