173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_R0021 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0048  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0048  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.555629  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3118  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1514  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0267785  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0034  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0046  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0353733  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0024  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0781725  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0744  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0027  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2577  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3055  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.379519  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3090  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.20543  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2036  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0712704 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.633427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0061  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.944304  normal  0.76215 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0021  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.829882 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.458906 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0701067  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.951593  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0040  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.983411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 72 bp  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.544366 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0077  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000000000693473  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0035  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.987391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0032  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.274432  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0085  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0843991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0089  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.548412  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0308  tRNA-Gly  89.13 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2370  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 76 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00487087  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0003  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0025  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.896099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0046  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0030  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 76 bp  50.1  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.218808 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0044  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.69312  normal  0.302799 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0015  tRNA-Ser  96.55 
 
 		 67 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.0082796  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0040  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 75 bp  50.1  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471615  normal  0.863144 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>