242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_09060 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3.9999999999999997e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  93.15 
 
 		 74 bp  105  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  91.78 
 
 		 74 bp  97.6  3e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  92.65 
 
 		 74 bp  95.6  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  87.7  3e-16  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  89.55 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  86.3 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  86.89 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  85.07 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0040  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697667  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0010  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_R0017  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0010  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0002  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00924229  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0057  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0004  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.50659  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0005  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000107449  hitchhiker  0.00000669742 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0309  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  hitchhiker  0.00278593  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0004  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.382329 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0004  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0263126  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>