172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_R0044 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  93.06 
 
 		 74 bp  103  5e-21  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  92.54 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 71 bp  91.7  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  92.42 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  90.41 
 
 		 74 bp  89.7  8e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  89.71 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 71 bp  79.8  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  88.41 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  86.96 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0009  tRNA-Gly  90 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  87.93 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  85.51 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  87.72 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0043  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0944227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  94.12 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  86.21 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0057  tRNA-Gly  90.24 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t007  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0006  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216667  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0014  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000252588  normal  0.0241581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0014  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000837111  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0011  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000511847  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0014  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0012  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471876  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1635  phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 		 534 bp  48.1  0.0003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.25448  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0154  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000000693037  hitchhiker  0.000107525 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0131  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000537425  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0008  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000140314  normal  0.0304222 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0125  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t005  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000000675609  normal  0.123199 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0013  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000562793  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0150  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00000000645582  hitchhiker  0.00000000139269 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_R0015  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000000368729  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0015  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000956602  hitchhiker  0.000519908 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  85.71 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0004  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 78 bp  46.1  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0006  tRNA-Ser  93.55 
 
 		 66 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.926314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0007  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00254544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0004  tRNA-Gly  93.55 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786418  normal  0.400526 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0085  tRNA-Gly  85.45 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0843991  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06802  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 72 bp  46.1  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  89.74 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>