60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_R0031 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  89.86 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  86.11 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  86.76 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  86.57 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  87.1 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  58  0.0000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4782  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0070  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26280  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.15189 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  83.56 
 
 		 74 bp  50.1  0.00007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  88.64 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  83.1 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t23  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 76 bp  44.1  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0065  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  96.15 
 
 		 71 bp  44.1  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0002  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19030  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>