66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4782 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4782  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0047  tRNA-Gly  94.44 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0115807  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0032  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.598279  normal  0.0388525 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0004  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.159928  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS01509  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.555954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0003  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.856118  normal  0.0346282 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0065  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0046  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.837906  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  88.24 
 
 		 74 bp  54  0.000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 71 bp  54  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0009  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 78 bp  54  0.000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 71 bp  54  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  85.33 
 
 		 75 bp  54  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  85.48 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  96.67 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0055  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  96.43 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06159  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0026  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.768519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00235  tRNA-Gly  84.72 
 
 		 72 bp  48.1  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0031  tRNA-Gly  87.23 
 
 		 74 bp  46.1  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390279  normal  0.72229 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0005  tRNA-Gly  84 
 
 		 75 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0106  tRNA-Gly  84.85 
 
 		 75 bp  44.1  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281433  hitchhiker  0.00000200758 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  83.87 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>