231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_R0025 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_11940  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.872315 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0025  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0957376  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_R0039  tRNA-Gly  97.18 
 
 		 74 bp  125  1e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09060  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 74 bp  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0250104 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_14027  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_R0024  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.2412  normal  0.247573 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0043  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_R0034  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.530843  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_R0058  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_R0031  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_R0030  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_R0031  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.754836  normal  0.341264 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_R0035  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 74 bp  109  8.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.072829  normal  0.169297 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_R0018  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 71 bp  101  2e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00399522  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_09840  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  8e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0598581  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  96.55 
 
 		 74 bp  99.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_R0034  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0045  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0957385  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_R0025  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.351803  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_R0039  tRNA-Gly  94.83 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_R0047  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0122655  normal  0.0125348 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1403  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_R0045  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.223661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  79.8  0.00000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1215  tRNA-Gly  89.66 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  88.52 
 
 		 74 bp  65.9  0.000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0063  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_R0045  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0153561 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_R0042  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  60  0.00000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0009  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  92.68 
 
 		 71 bp  58  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0073  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0062  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0121694  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0007  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000010318  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0028  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.90981 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  87.27 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna36  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>