279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_R0041 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  97.3 
 
 		 74 bp  131  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  94.59 
 
 		 74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0044  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265162  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0059  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000597216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0074  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000352958  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  93.24 
 
 		 74 bp  107  4e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0085  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0843991  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0089  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 74 bp  99.6  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.548412  normal  0.42362 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0072  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0211705  normal  0.918041 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_R0038  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0064  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_R0028  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.721667  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0032  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0069  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024134  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0023  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000259024  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0039  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000000372449  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0041  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0018  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0054  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.809782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0030  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000137956  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_R0047  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4556  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0057  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.564977  normal  0.743111 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  90.32 
 
 		 71 bp  75.8  0.000000000001  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0001  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_R0021  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000145093  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0003  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0029  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023442  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0264  tRNA-Gly  87.67 
 
 		 74 bp  73.8  0.000000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000581931  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0010  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000137284  normal  0.0116313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  88.71 
 
 		 71 bp  67.9  0.0000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3086  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000101818  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0078  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000230991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0058  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0024  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.663952  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0060  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.0000000611366  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2315  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_R0051  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0071  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000687699  normal  0.228297 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0003  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>