134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_R0056 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_R0032  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.598279  normal  0.0388525 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  92.31 
 
 		 71 bp  71.9  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4782  tRNA-Gly  89.83 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0143888  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0007  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.0000010318  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 78 bp  56  0.000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00235  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06159  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 75 bp  56  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0029  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000116623  normal  0.0769122 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24410  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.437123  normal  0.656615 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_R0031  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.577391  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 77 bp  52  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  87.04 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>