124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene tRNA-Gly-8 on replicon NC_006274
Organism: Bacillus cereus E33L



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  3e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0301  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000859433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  6e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  6e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  87.32 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  85.92 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  85.92 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA61  tRNA-Gly  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  83.78 
 
 
74 bp  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  87.04 
 
 
71 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0015  tRNA-Gly  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0016  tRNA-Gly  93.75 
 
 
75 bp  48.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RS05586  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000136136  normal  0.200305 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00107854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_R0011  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  2.9187400000000002e-24  normal  0.0779261 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_AR0057  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00632698  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0006  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.328073  hitchhiker  0.00695117 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3796  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000000939303  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0013  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000164045  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_R0012  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000183499  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0066  tRNA-Gly  93.55 
 
 
75 bp  46.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000558399  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3188  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000469441  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1904  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.0000012603  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3764  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3826  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.216257  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3459  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000712395  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0008  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280615  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0013  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000179187  normal  0.143307 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_R0008  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160703  hitchhiker  0.000000000125481 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_R0013  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000000407891  normal  0.589115 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_R0043  tRNA-Gly  93.55 
 
 
76 bp  46.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.607028  normal  0.490621 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0058  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000136383  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0049  tRNA-Gly  87.23 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.323662  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>