27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_R0008 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010531  Pnec_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000160703  hitchhiker  0.000000000125481 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_R0008  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000280615  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0059  tRNA-Gly  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000102319 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0042  tRNA-Gly  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034055 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0040  tRNA-Gly  93.75 
 
 
76 bp  48.1  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755503 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  83.58 
 
 
77 bp  46.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  83.58 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>