123 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_R0040 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  98.59 
 
 		 71 bp  133  6e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  92.96 
 
 		 74 bp  101  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  91.53 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0301  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000859433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 74 bp  77.8  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0066  tRNA-Gly  88.89 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000867267  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  90.38 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  95 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  95 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  88.46 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0023  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.021733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0567  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  95 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  96.88 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  95 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  95 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  89.36 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  93.94 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0018  tRNA-Gly  91.89 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>