79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcer98_R0122 on replicon NC_009674
Organism: Bacillus cytotoxicus NVH 391-98



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0301  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000859433  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  100 
 
 
77 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  100 
 
 
74 bp  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  91.55 
 
 
71 bp  93.7  5e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  87.32 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  85.92 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  85.92 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  92.5 
 
 
71 bp  56  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3852  tRNA-Gly  84.51 
 
 
74 bp  54  0.000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0347948 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4211  tRNA-Gly  84.51 
 
 
74 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_R0011  tRNA-Gly  84.51 
 
 
74 bp  54  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  87.04 
 
 
71 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  90 
 
 
71 bp  48.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA61  tRNA-Gly  84.75 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  83.1 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  83.1 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_R0070  tRNA-Gly  83.1 
 
 
71 bp  46.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0869039  normal  0.608865 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0003  tRNA-Gly  83.1 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0002  tRNA-Gly  83.1 
 
 
74 bp  46.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_R0045  tRNA-Gly  93.33 
 
 
71 bp  44.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.485198  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>