166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t0037 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.881169  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0037  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0084  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0040  tRNA-Gly  95.77 
 
 		 71 bp  117  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0056  tRNA-Gly  94.37 
 
 		 71 bp  109  8.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000268197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0637  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000118673  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5666  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000047392  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5686  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000717996  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5710  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000586267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5715  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.201708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0296207  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000228413  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000161522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00298104  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-3  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  2.7190299999999995e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000386935  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000206575  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000014568  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000140083  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Gly-8  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 77 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00371423  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4567  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0545  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3943e-45 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4986  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000743602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-4  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000188578  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-6  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.0000000000000146044  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Gly-7  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0660742  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0279  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0229  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000723342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5017  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00202999  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4618  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000037531  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5042  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5674  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000102685  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0619  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.152759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5794  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000551113  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5802  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00821355  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0053  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000840189  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0089  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0140643  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0117  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0122  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0177171  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5721  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.293736  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4757  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000781489  hitchhiker  6.01027e-18 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0053  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000226275  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0093  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.778252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0121  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000324083  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0126  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 71 bp  93.7  5e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.876495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0301  tRNA-Gly  91.55 
 
 		 74 bp  93.7  5e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000859433  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1569  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1604  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.841854 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 71 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  90.14 
 
 		 74 bp  85.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0092  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000000423712  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 74 bp  69.9  0.00000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0056  tRNA-Gly  90.91 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_R0041  tRNA-Gly  95 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_R0031  tRNA-Gly  95 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.271657  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0017  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000000450697  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0006  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0216519  normal  0.996112 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t44  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0414415  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0023  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.021733  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0567  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0042  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000364982  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0057  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  88.14 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0052  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 73 bp  61.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000202976  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0014  tRNA-Gly  93.62 
 
 		 76 bp  61.9  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_R0030  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  hitchhiker  0.000875234  hitchhiker  0.000341426 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0066  tRNA-Gly  87.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000867267  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  92.5 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lppt05  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt05  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0036  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 71 bp  54  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.828148  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_R0053  tRNA-Gly  91.49 
 
 		 75 bp  54  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000611222  hitchhiker  0.00795761 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  86.44 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0056  tRNA-Gly  84.51 
 
 		 74 bp  54  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>