266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_R0043 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_R0043  tRNA-Gly  100 
 
 
71 bp  141  1.9999999999999998e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0944227  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  95.77 
 
 
74 bp  117  3e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0009  tRNA-Gly  94.37 
 
 
71 bp  109  8.000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_tRNAGlyVIMSS1309292  tRNA-Gly  92.96 
 
 
71 bp  101  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_R0014  tRNA-Gly  90.14 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000379014  normal  0.408699 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_R0050  tRNA-Gly  90.14 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000235663  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_R0015  tRNA-Gly  90.14 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.685184  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0064  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0016  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.827613  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0034  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000457466  normal  0.978086 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0088  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0052  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000802106  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0086  tRNA-Gly  88.73 
 
 
74 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.795168  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0081  tRNA-Gly  88.73 
 
 
71 bp  77.8  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0459508  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_R0003  tRNA-Gly  91.38 
 
 
74 bp  75.8  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0026  tRNA-Gly  93.88 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.594992  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  95.56 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_R0017  tRNA-Gly  91.07 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.162954  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_tRNAGlyVIMSS1309344  tRNA-Gly  91.07 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0013  tRNA-Gly  97.5 
 
 
75 bp  71.9  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.000000316853  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_tRNAGlyVIMSS1309190  tRNA-Gly  91.07 
 
 
71 bp  71.9  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.179054  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-2  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Gly-5  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000507298  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0071  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000022788  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_R0005  tRNA-Gly  87.32 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0049  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.401783  normal  0.991667 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_R0006  tRNA-Gly  87.32 
 
 
71 bp  69.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0032  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000435638  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0071  tRNA-Gly  87.32 
 
 
74 bp  69.9  0.00000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000447795  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_R0016  tRNA-Gly  89.66 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000070019  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  91.84 
 
 
71 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_rna5  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.627053  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12430  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_R0053  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000000118359  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  91.84 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0009  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000197964  hitchhiker  0.00000895065 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  93.33 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_R0053  tRNA-Gly  91.84 
 
 
74 bp  65.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.000000000571258  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  91.84 
 
 
75 bp  65.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  91.84 
 
 
71 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06159  tRNA-Gly  95 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0062  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02828  tRNA-Gly  95 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0035  tRNA-Gly  89.29 
 
 
71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_R0004  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_R0049  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000210611  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  91.67 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1112t  tRNA-Gly  95 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  95 
 
 
78 bp  63.9  0.000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  91.67 
 
 
71 bp  63.9  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00235  tRNA-Gly  95 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNAGlyVIMSS1309148  tRNA-Gly  89.29 
 
 
71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06802  tRNA-Gly  95 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0059  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000205536  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0057  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.90337 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0056  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.661302  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNAGlyVIMSS1309072  tRNA-Gly  89.29 
 
 
71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNAGlyVIMSS1309123  tRNA-Gly  89.29 
 
 
71 bp  63.9  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.658382  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_AR0067  tRNA-Gly  93.18 
 
 
74 bp  63.9  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.38974  normal  0.157236 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  95 
 
 
75 bp  63.9  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3206t  tRNA-OTHER  95 
 
 
72 bp  63.9  0.000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0593259  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Gly-1  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00109047  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0019  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0110  tRNA-Gly  85.92 
 
 
71 bp  61.9  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_R0036  tRNA-Gly  85.92 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.048485  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2053  tRNA-OTHER  94.74 
 
 
68 bp  60  0.00000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000041496  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_R0060  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_R0043  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000110087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_R0005  tRNA-Gly  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000162881  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0106  tRNA-Gly  89.8 
 
 
75 bp  58  0.0000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000281433  hitchhiker  0.00000200758 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>