244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amuc_R0044 on replicon NC_010655
Organism: Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  90.54 
 
 		 74 bp  91.7  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  89.19 
 
 		 74 bp  83.8  0.000000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_R0016  tRNA-Gly  89.04 
 
 		 74 bp  81.8  0.00000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.511994  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t22  tRNA-Gly  88.73 
 
 		 71 bp  77.8  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.656712  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_R0085  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0000318176  normal  0.990431 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t06  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.490066  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA68  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000000111768  normal  0.639487 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0009  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_09150  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0613367 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R88  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000223228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0007  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_R0015  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000649804  normal  0.0121052 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_R0018  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_R0017  tRNA-Gly  87.84 
 
 		 74 bp  75.8  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.255177  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  90.16 
 
 		 71 bp  73.8  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0068  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.911099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0820  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0945604  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_R0033  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 74 bp  71.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.170039 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0562  hypothetical protein  93.75 
 
 		 141 bp  71.9  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000293219  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5034  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.616369  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5030  tRNA-Gly  93.75 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.539673  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t06  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000883403  unclonable  0.000000195442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08660  tRNA-Gly  87.32 
 
 		 71 bp  69.9  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000214078  hitchhiker  0.000527439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_R0012  tRNA-Gly  92.16 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0005  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09500  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_60030  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0043  tRNA-Gly  93.33 
 
 		 71 bp  65.9  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0944227  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00076  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00000423625  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0092  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154336  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2721  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000223193  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0063  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.220412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4386  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000113588  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0005  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00000491266  normal  0.390681 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4695  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  5.29308e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0107  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000460652  hitchhiker  0.00217641 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_rna007  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4550  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000345033  hitchhiker  0.00000000000121992 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0490  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.826084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4426  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.0000000000739048  hitchhiker  0.0000476038 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna050  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000672543  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_tGly01  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 78 bp  63.9  0.000000005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000588593  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5443  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000114766  hitchhiker  0.00132893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4354  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0000000304012  normal  0.98071 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4476  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000038079  hitchhiker  0.00000000000000785716 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_R0044  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0741323  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0698  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00121364  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_R0020  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156043  normal  0.538933 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_R0042  tRNA-Gly  89.29 
 
 		 74 bp  63.9  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000123323 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4473  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.0000778472  hitchhiker  0.000364054 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4719  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  1.20782e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1180  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000000995593  hitchhiker  0.000000000000787361 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5102  tRNA-Gly  91.67 
 
 		 75 bp  63.9  0.000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000061566  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t007  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0125  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000108683  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6019  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00348951  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0014  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000252588  normal  0.0241581 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0014  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000837111  hitchhiker  0.00969138 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_R0009  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.365276  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0014  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000323957  normal  0.0855349 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_R0043  tRNA-Gly  85.92 
 
 		 71 bp  61.9  0.00000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.11456  normal  0.782815 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0012  tRNA-Gly  90.2 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000471876  hitchhiker  0.000087686 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0035  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0578114  normal  0.382636 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_R0040    85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0052  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0161202 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0055  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.3002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_R0021  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.292095 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2154  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.480765  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2514  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0272965  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2521  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000668115  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2524  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000475976  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2532  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000000101375  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2620  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0852955  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2627  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2629  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1865  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2218  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000193879  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2225  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000670564  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2228  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000002233  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2306  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000790544  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2313  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_R0037  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_R0012  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA37  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0779293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_R0022  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.600355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0078  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0007  tRNA-Gly  85.14 
 
 		 74 bp  60  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>