27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_6019 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_6019  tRNA-Gly  100 
 
 		 74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00348951  normal  0.207777 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0008  tRNA-Gly  86.49 
 
 		 74 bp  67.9  0.0000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.297445  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0406  tRNA-Gly  88.33 
 
 		 71 bp  63.9  0.000000005  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  hitchhiker  0.00766095  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0044  tRNA-Gly  94.87 
 
 		 74 bp  61.9  0.00000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000110049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0049  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.111127  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_R0025  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_R0014  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.030133  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0025  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 74 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000880116  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_R0034  tRNA-Gly  86.67 
 
 		 71 bp  56  0.000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.849322  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0053  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.0000000779558  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0023  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00977111  normal  0.654981 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0561  tRNA-Gly  83.78 
 
 		 74 bp  52  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000476059  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0056  tRNA-Gly  100 
 
 		 71 bp  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.869004  normal  0.328325 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0040  tRNA-Gly  85.96 
 
 		 71 bp  50.1  0.00007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.697667  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_R0048  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_R0034  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_R0041  tRNA-Gly  85 
 
 		 74 bp  48.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.226766  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_R0032  tRNA-Gly  85 
 
 		 71 bp  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.629344  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_R0018  tRNA-Gly  96.3 
 
 		 71 bp  46.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_R0018  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.395535  normal  0.2939 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_R0017  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.292285 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0041  tRNA-Gly  91.18 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.771709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4566  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.778703  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0005  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0035  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0017  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877648 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1214  tRNA-Gly  82.43 
 
 		 74 bp  44.1  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>